摘    要

目的：比较曼地亚红豆杉和南方红豆杉表型、紫杉醇及衍生物、黄酮类的含量、与紫杉醇合成途径相关的基因和蛋白质的表达水平等差异，为南方红豆杉资源开发利用提供依据。方法：采用TMT标签结合高效液相色谱串联质谱、转录组分析、及生物信息学分析方法等技术进行筛选。结果：分析确定了曼地亚红豆杉和南方红豆杉之间紫杉醇及衍生物含量的差异；通过转录组测序，鉴定了88,194个差异表达基因；同时通过蛋白组测序，鉴定了4,834个差异表达蛋白。进一步，我们分析了上述差异基因及蛋白所参与的代谢途径，鉴定了一批可能解释不同红豆杉代谢差异的基因和蛋白质，得到了大量与紫杉醇代谢相关的有价值遗传信息。结论：本实验鉴定得到了一系列红豆杉紫杉醇累积种间差异的调控基因和蛋白质，为进一步综合开发利用南方红豆杉提供理论依据。

目录

摘    要 2

Abstract 2

引言 4

第一章 材料与方法 5

1.1实验材料 5

1.2实验方法 6

1.2.1 有效成分的提取和分离 6

1.2.2 紫杉醇及其衍生物含量、黄酮类的差异鉴定 6

1.2.3 蛋白质提取 6

1.2.4 胰蛋白酶消化和TMT标记 7

1.2.5 RNA的提取 7

1.2.6 cDNA文库制备和测序 8

1.2.7 生物信息学分析 8

第二章 实验结果和分析 8

2.1 不同红豆杉的表型差异 8

2.2 不同红豆杉紫杉醇及其衍生物含量的差异 8

2.3 紫杉醇合成相关的差异表达基因 9

2.4 紫杉醇含量差异相关的差异表达蛋白（DEPs） 10

第三章 结论和展望 10

3.1结论 10

3.2南方红豆杉开发利用的展望和建议 12

参考文献 14

致谢 16