摘要:桡足亚纲（Copepoda）隶属于节肢动物门（Arthropoda），甲壳纲（Crustacea）。桡足亚纲总共有2个总目，分别是裸甲总目（Gymnoplea）和足甲总目（Podoplea），7个目分别为哲水蚤目（Calanoida）、 剑水蚤目（Cyclopoida）、猛水蚤目（Harpacticoida）、小虱水蚤目（Misophrioida）、摩门水蚤目（Monstrilloida）、鞘口目（Poecilostomatoida）和管口目（Siphonostomatoida）。目前所得到的分类都是依据形态学特征进行的，所以进一步基于分子证据，即各目DNA间的关系进行分类就显得尤为重要。

因此，本论文聚焦于分析桡足亚纲的系统发育关系亟需解决的问题是：桡足亚纲7个目间的系统发育关系。本论文通过选取7个目中12个代表的物种，分别基于18SrRNA、28SrRNA以及COⅠ序列对各个目构建了三种不同类型的系统发育树。 

关键词：桡足亚纲　核基因序列　系统发育推断　系统发育树

目录

摘要

ABSTRACT

1.前言-1

1.1桡足亚纲的介绍-1

1.2系统发育推断-1

1.3 拓扑结构的构建-3

1.4  MEGA软件介绍-4

2.科学研究-6

2.1  研究背景-6

2.2  材料与方法-6

2.3  结果与分析-7

2.4. 结论与展望-22

致谢-23

参考文献-24