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摘 要
近年来蛋白质组学技术迅速发展,其中具有代表性的是相对和绝对定量同位素标记( i TRAQ) 技术与高度敏感性和准确性的串联质谱及多维液相色谱联用技术。iTRAQ技术已成为蛋白质定性和定量研究的主要工具之一。本实验采用iTRAQ筛选肺肾阴虚证儿童哮喘患者血清中的差异性蛋白[ 刘姬艳,王瑛,王远照,朱佳文,戴芳甸.同位素标记相对和绝对定量蛋白组学技术筛选儿童哮喘不同病情控制水平血清差异蛋白[J].中国医学科学院学报,2017,39(06):817-826.
]。并通过生物信息学分析筛选差异蛋白。主要用到的技术有差异蛋白Gene Ontology(GO)功能分析、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)数据库进行信号转导通路分析和利用Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins(STRING)软件进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析。结果:从260种血清蛋白中筛选出与其他组别相比均表达差异的肺肾阴虚证儿童哮喘差异蛋白质共29种(取变化倍数<0.8或>1.2),主要涉及18个重要的生物过程,7种分子功能,定位在15种不同的细胞结构;29个差异蛋白中16个蛋白主要涉及26个通路。结论:本实验共获得肺肾阴虚证儿童哮喘患者血清中的特征性蛋白29种,这些特征性蛋白可以作为鉴别肺肾阴虚证小儿哮喘的候选蛋白。
目录
1引言 4
2材料与方法 5
2.1材料 5
2.2试剂 5
2.3主要实验仪器 5
2.4试验方法 6
2.4.1血清差异蛋白的鉴定及定量 6
2.4.2 i TRAQ试剂的标记及检测: 6
2.4.3毛细管高效液相质谱检测及鉴定 8
2.4.4质谱数据统计分析 9
2.4.5 生物信息学分析 10
3结果 11
3.1肺肾阴虚证组特征蛋白筛选 11
3.2差异蛋白GO分析 17
3.3差异蛋白通路富集分析 17
3.4差异蛋白的PPI相互作用网络图 18
4讨论 19 |

