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摘要
目的:利用定量蛋白组学技术筛选儿童哮喘三种证候(肺脾气虚证、肺肾阳虚证、肺肾阴虚证)之间的差异蛋白并进行功能分析,为中医临床上的分型辨证提供参考。方法:采用iTRAQ同位素相对标记和绝对定量技术联合二维液相色谱串联质谱技术筛选出三种证候间表达差异蛋白并对差异蛋白进行生物信息学的分析。结果:将儿童哮喘三证候组中蛋白含量两两相比,即对脾肾阳虚证组,肺肾阴虚证组,肺脾气虚证组进行蛋白含量组间比较,数据显示,共有60个蛋白质在儿童哮喘不同中医证候组之间两两比较有差异性表达(变化倍数< 0.8或变化倍数> 1.2)。蛋白质的生物信息学分析显示,60个差异蛋白中有48个蛋白主要参与了包括细胞过程、单有机体过程、代谢过程、刺激相应、生物过程调节等21个重要的生物过程;47个蛋白主要具有包括结合活性、催化活性、分子功能调节器、转运活性和结构分子活性等8种分子功能;细胞成分分析显示,差异蛋白中的48个蛋白主要定位在17种不同的细胞结构,包括胞外区、胞外区组分、细胞器、细胞、细胞组等。结论:儿童哮喘三证候间筛选的差异蛋白可为后续鉴定验证儿童哮喘证候生物标志物提供参考。
目录
定量蛋白组学技术筛选儿童哮喘证候差异性蛋白 1
1 前言 4
2 材料与方法 4
2.1 主要试剂与仪器 4
2.1.1 主要试剂 4
2.1.2 主要实验仪器 5
2.2 研究对象 5
2.3 实验方法 6
2.3.1 血清差异蛋白的鉴定与定量 6
2.3.2 iTRAQ标记及检测 6
2.3.3 毛细血管高效液相质谱检测及鉴定 7
2.3.4 质谱数据的统计分析 8
2.3.5 生物信息学分析 8
3 结果 8
3.1 差异蛋白的筛选 8
3.2 差异蛋白的GO分析 16
3.3 差异蛋白的通路富集分析 16
3.4 差异蛋白的PPI相互作用网络图 17
4 讨论 18
参考文献 20
致谢 22 |

