摘要

SBP基因作为植物中重要的一类转录因子基因家族，在植物的生长发育过程中发挥着重要的作用。本研究利用全基因组信息技术鉴定了大麦中11个SBP基因，并对其基因结构、基因定位、理化性质、进化关系及表达情况等进行了科学的分析。结果发现，大麦中11个SBP基因可分为5个亚族，且不同亚族间具有不同程度的差异，相同亚族间表现出更近缘的结构和功能相似性。SBP蛋白质分子量、表达量以及基因内含子数目的最大值均发生在第六亚族，其等电点的差异不大，蛋白质的酸碱度均偏碱性，处于6.23-9.26之间。

目录

大麦SBP基因家族的生物信息学分析 1

摘要 2

Abstract 2

1. 引言 5

1.1 SBP基因家族概述 5

1.1.1 SBP基因家族的发现 5

1.1.2 SBP基因的结构 5

1.1.3 SBP基因的生物学功能 6

2.1 生物信息学的应用 6

1.2.1 测序及序列对比 6

1.2.2 蛋白质结构预测及对比 7

1.2.3 分子进化和比较基因组学 7

1.2.4 其他 8

3.1 SBP基因家族的生物信息学研究现状 8

4.1 本研究的目的及意义 9

2. 材料与方法 9

2.1 SBP 基因序列的检索与筛选 9

2.2.1 SBP基因结构域的确定及检索 9

2.2.2 SBP基因的筛选及去冗余 10

3.1 构建进化树 10

2.3.1 SBP蛋白质序列的比对 10

2.3.2 进化树的构建与可视化 10

4.1 理化性质分析 11

5.1 基因结构与染色体定位 11

2.5.1 基因结构分析 11

2.5.2 染色体定位分析 11

6.1 表达量分析 11

3. 结果与分析 12

3.1 大麦SBP 基因家族的进化分析 12

4.1 SBP 基因家族的成员特性分析 13

3.4.1 等电点与分子量分析 13

3.4.2 SBP基因表达量分析 14

5.1 SBP 基因结构与定位分析 15

3.5.1 SBP基因结构分析 15

3.5.2 染色体定位分析 16

4. 讨论 16